研究报告

辣椒 HD-Zip 转录因子家族鉴定与生物信息学分析  

陈国梁1,2* , 高瑜1 , 张昊1 , 王亚洁1 , 王睿1 , 王延峰1,2
1 延安大学生命科学学院, 延安, 716000; 2 延安大学, 陕西省红枣重点实验室, 延安, 716000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2019年04月15日    接受日期: 2019年04月22日    发表日期: 2020年05月28日
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摘要

从辣椒基因组数据库中鉴定 HD-Zip 转录因子,并对其进行生物信息学分析。对鉴定到的转录因子的基本理化性质、染色体定位、系统进化、保守基序和基因结构进行分析。共鉴定到 45 个辣椒 HD-Zip 转录因子;该家族成员均含有高度保守的 HD-Zip结构域;45 HD-Zip 基因以不均匀的方式分布在 12 条染色体上。根据拟南芥 HD-Zip家族分类关系,在结合辣椒 HD-Zip 基因结构的特点分为 GroupIGroupIIGroupIIIGroupIV。辣椒 HD-Zip 转录因子在同一亚族中含有相同的保守基序和基因结构。本研究初步明确了辣椒 HD-Zip 转录因子家族成员进化关系和结构特点,为进一步研究辣椒 HD-Zip 转录因子家族的系统发育以及生物学功能提供了依据,为辣椒的分子育种提供科学依据。
 

关键词
辣椒(Capsicum annum L.);HD-Zip;转录因子;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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